5 - méthyluridine est principalement utilisée comme réactif de synthèse biochimique et une matière première de base pour la chimie médicinale. C'est un intermédiaire important pour les médicaments antiviraux tels que la zidovudine, la stavudine et l'allovudine, et a une valeur d'application significative dans la production pharmaceutique, la recherche et le développement et d'autres domaines.
